Neuf de ces titres, cependant, sont arrivés avant même la naissance du MotoGP en 2002 et le succès continu de Ducati dans la catégorie reine du championnat du monde de moto. En effet, Ducati n’a jamais concouru dans la classe 500 cm³, à l’exception de performances sporadiques au début des années 1970 avec Bruno Spaggiari, Phil Read et Paul Smart : avec sa 3e place aux Nations 1972, l’Italien a donné à Ducati son seul podium dans la classe 500 cm³.
Ducati a fait ses débuts en MotoGP en 2003 et lors du 6e GP, à Montmelò, il a réussi à monter sur la plus haute marche du podium grâce à Loris Capirossi. Le pilote d’Imola a ensuite remporté deux courses en 2005 et trois en 2006, mais il devra attendre 2007 pour remporter le championnat du monde.
En 2007, en effet, Ducati a remporté le titre MotoGP grâce à sa nouvelle recrue Casey Stoner, qui a étonné tout le monde en remportant 10 victoires, 14 podiums, 5 pole positions et 367 points, devenant ainsi champion dans le pays de ses rivaux, le Japon, le jour de la dernière victoire de Capirossi au championnat du monde - et avec Ducati.
Cette année-là, cependant, les constructeurs japonais ont pris leur revanche en Superbike, en remportant les trois premières places du classement avec autant de marques différentes. Ducati a dû se contenter de la 4e place pour Bayliss, la 6e pour Ruben Xaus et la 7e pour Lorenzo Lanzi.